Powszechnie wiadomo, że koty syberyjskie należą do najzdrowszych ras. Mimo to należy dbać i pamiętać o podstawowych szczepieniach przeciwko najgroźniejszym kocim chorobom. Hodowcy sprzedają najczęściej kotki już z kompletem szczepień, bądź już jest wstępnie zaszczepiony i należy go powtórzyć szczepionkę w wyznaczonym terminie. Termin następnego szczenienia z reguły należy powtórzyć za rok, a następnie szczepienia ponawiać co 2-3 lata.

Najnowsze badania dowodzą, że odporność poszczepienna utrzymuje się dużo dłużej niż rok, ponadto zbyt częste szczepienia mogą być niekorzystne. Aby jednak nasz kot uzyskał odporność po szczepieniach, musi być w chwili szczepienia zdrowy, jak również w okresie poszczepiennym. Nie może być również zarobaczony (co może się zdarzyć), dlatego warto zsynchronizować kalendarz odrobaczania z kalendarzem szczepień.

Bezwzględnie przeciw tzw. kociemu tyfusowi (panleukopenii) oraz tzw. kociemu katarowi (herpeswirozie i caliciwirozie). Obie choroby są bardzo groźne, czasami śmiertelne, a narażone na nie mogą być nawet "niewychodzące" koty, ponieważ wirusy mogą być przyniesione na butach domowników czy ubraniu.

Szczepienia przeciw innym kocim chorobom należy traktować jako szczepienia uzupełniające i stosować w zależności od trybu życia kota oraz zagrożenia tymi chorobami w danym środowisku. Do szczepień, które należy stosować w przypadku kotów "wychodzących" lub biorących udział w kocich wystawach, należy białaczka i wścieklizna. Kotom "niewychodzącym" nie zaleca się tych szczepień, ponieważ istnieje ryzyko (na szczęście niewielkie), wystąpienia powikłań w postaci mięsaków poszczępiennych, będących nowotworami z tendencją do nawrotów. Białaczka kotów jest chorobą spowodowaną przez wirus, który ginie w środowisku zewnętrznym bardzo szybko, dlatego nie możemy przynieść go do domu na butach, do zakażenia dochodzi tylko przy bliskim kontakcie kota zdrowego z chorym (lizanie, wspólne miski, odwiedzanie miejsc zainfekowanych niedawno przez chorego kota). Zagrożenie mięsakiem poszczepiennym według najnowszych informacji zostało ostatnio zminimalizowane dzięki wprowadzeniu szczepionek przeciw białaczce nie zawierających adiuwanta glinowego, będącego przyczyną tych powikłań.

Na razie nie ma danych odnośnie wycofania adiuwanta ze szczepionki przeciwko wściekliźnie, dlatego kotom którym to szczepienie jest zalecane, szczepionkę należy podawać podskórnie , raz na jednej, raz na drugiej kończynie tylnej (nie w kark), zaznaczając miejsce szczepienia w książeczce zdrowia kota.

Pozostałe szczepienia:

• Chlamydioza: szczepionka przeciw chlamydiozie jest mało skuteczna, a jej działanie jest krótkotrwałe (leczenie chlamydiocy nie przysparza większych trudności).
• Zakaźne zapalenie otrzewnej (FIP) : poza przypadkami częstego występowania tej choroby w danym środowisku , szczepienie przeciw FIP nie jest zalecane.
• Grzybica (microsporum canis i tryhophyton): szczepionka bywa stosowana jako leczenie wspomagające przy już zaistniałej chorobie bądź w przypadku przebywania kota w środowisku gdzie występuje grzybica.